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我国科研团队发布开源核糖核酸序列基础模型

记者从中国科学技术大学获悉,该校科研团队发布一款开源核糖核酸(RNA)序列基础模型structRFM,提高了模型在RNA结构预测与功能推断一系列下游任务中的性能,有望助力人工智能驱动的科学研究、生物学机制理解、药物发现等。5日,相关研究成果发表于国际学术期刊《自然》。

核糖核酸(缩写为RNA)是一种重要的生物大分子,存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中,广泛参与蛋白质合成等生命过程,其功能与序列、折叠结构密切相关。理解序列、结构与功能之间的联系,是揭示RNA生物学机制的重要基础,也是药物发现的支撑要素。

随着测序技术的发展,研究者积累了海量RNA序列数据。借鉴自然语言处理中的预训练方法,RNA基础模型能够从这些数据中学习序列规律,提取可用于不同任务的通用特征,为结构预测和功能分析提供支持。

中国科大研究团队研发出RNA基础模型structRFM,预训练后的模型仅需输入序列,即可提取序列级、核苷酸级和核苷酸对级特征,用于多种结构与功能推断任务,并在多项任务中达到国际前沿水平。

研究人员介绍,目前,实验室已开放完整配对数据、模型权重和源代码,为研究结果的复现和相关模型的开发提供了可复用资源。

(总台记者 王利)

[责任编辑:朱国义]

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