10月13日，记者从内蒙古自治区卫健委了解到，2019年9月，全区法定传染病报告发病总数9333例，较上月上升5.16%，较去年同期上升38.06%；死亡11例（艾滋病4例、乙肝1例，肺结核4例，梅毒2例），较上月上升 57.14%，较去年同期上升 57.14%。
无甲类传染病报告；乙类传染病报告5456例，与上月相比下降 13.47%，病种有艾滋病、甲肝、乙肝、丙肝、戊肝、肝炎（未分型）、麻疹、出血热、炭疽、痢疾、肺结核、伤寒、副伤寒、百日咳、猩红热、布病、淋病、梅毒；丙类传染病报告3877例，与上月相比上升50.86%，病种有流行性感冒、流行性腮腺炎、风疹、急性出血性结膜炎、包虫病、其它感染性腹泻病、手足口病。
另外，9月份共报告突发公共卫生事件1起。2019年9月17日内蒙古锡林郭勒盟阿巴嘎旗幼儿园发生手足口病疫情，发病33人，无死亡病例。