近年来二连浩特检验检疫局进一步规范和口岸传染病排查和核生化反恐业务，不断巩固口岸核心能力建设成果，建立了口岸核心能力持续提升的长效机制，使口岸卫生检疫工作取得了新的成效。
一是强基础。推动铁路口岸旅检通道实现出入境通道分开运行，公路旅检出境检疫查验设施面积达150平米，入境检疫查验设施面积达120平米，设立了医学排查室、隔离留验室、快速检测室等专业用房和放射性监测仪、红外体温监测仪等各类检疫查验实施设备，以及疑似病人移送转运通道。购置了核素分析仪、铅防护服、放射性个人剂量计、快速侦检试剂等专业设备和用品，并严格做好仪器设备的使用和维护记录等，使各类设施设备时时处于正常运转状态，口岸核心能力应急硬件水平得到了显著提升。
二是抓制度。全面梳理相关法律法规、规范性文件、部门规章、标准规程、应急预案、技术方案和作业指导书，将其纳入全局质量管理体系进行动态管理，优化制度设计，完善制度建设，努力实现卫生检疫执法权限化、执法责任、执法程序、执法行为、执法监督的规范化和制度化。