内蒙古河套灌区管理总局在全国率先试点推行“管养分开”的国管工程体制改革，成立了专业养护队伍，灌区管养分离改革取得显著成效。
近年来，河套灌区管理总局以灌区节水改造工程等重点水利工程项目建设为契机，围绕“两改一提高”的目标，制定了一系列提升推进管养分离改革的相关制度，对工程管护实现量化管理和考核，使岁修养护经费发挥显著投资效益，从体制上扭转了“重建轻管”的局面，有效延长了工程使用寿命。
目前，全灌区2500千米骨干渠沟上，2994座骨干建筑物全面推行了管养分离。通过“管养分离”的体制改革，制定管理标准与质量，明确工程管护的责任，实现工程运行与管护的互相监督和制约。