海关总署坚决贯彻习近平总书记重要指示批示精神，认真落实党中央、国务院有关工作部署，坚定信心、同舟共济、科学防治、精准施策，在全国各通关现场设立专门受理窗口和绿色通道，为疫情防控物资提供便捷高效通关服务。
1月24日晚，海关总署向武汉海关下发通知，要求设立专门受理窗口和绿色通道，第一时间为相关物资办理通关手续，对进口捐赠物资实施快速验放，并通知各关参照执行。
1月26日凌晨发布公告，境外捐赠的疫情防控物资，海关可凭医药主管部门的证明先登记放行，后补办相关手续。
1月27日，按照特事特办原则，海关总署进一步制发通知明确进口疫情防控物资快速通关措施，对专门用于疫情防控治疗的进口药品、医疗器械等，包括通过各类运输方式进口、旅客携带和通过邮寄快递方式进境的疫情防控物资，做到即到即提，确保通关“零延时”，以最短的时间投入疫情防控；要求全国所有隶属海关设立咨询热线，并在主要媒体公布，专人负责值守，第一时间响应企业需求，解答问题，指导办理通关业务；启动相关物资进口信息收集汇总机制，加强进口疫情防控物资数据统计，为做好疫情防控物资供应保障提供决策参考。同时，积极做好供港澳物资的通关服务保障工作。