清朝时期，尤其是康熙和乾隆年间，藏传佛教在内蒙古地区广泛的传播，各地修建了许多的藏传佛教寺庙，拉僧庙就在这个时候建立起来。满巴拉僧庙建立之初，就是作为培养蒙医的场所，建筑的风格则主要模仿了西藏的一些寺庙。
清朝时期，尤其是康熙和乾隆年间，藏传佛教在内蒙古地区广泛的传播，各地修建了许多的藏传佛教寺庙，拉僧庙就在这个时候建立起来。满巴拉僧庙建立之初，就是作为培养蒙医的场所，建筑的风格则主要模仿了西藏的一些寺庙。当时庙里的喇嘛要吟诵医学有关的经书，主要分为四个方向，包括沙德尔经(病理学)、码德珠玛经(药理学)、西码珠德经(诊断医疗方法)和医点要领(基础理论)，合称为《四部集》。
在满巴拉僧庙鼎盛时期，庙中常住的僧人喇嘛有600多人，每逢庙会的时候，前来求医看病和参拜佛祖的人络绎不绝。在那个时期，庙会时还有五台山，拉萨，塔尔寺，拉扑楞寺等佛教圣地的高僧前来交流，从这也可以看出满巴拉僧庙曾经在宗教医学中的崇高地位。
满巴拉僧庙毁于文革后，在近代又进行了重建，新建的满巴拉僧庙比曾经的建筑更为的宏伟壮观，并且在重建时巧妙的融合了汉藏两种不同的艺术风格，非常的漂亮。
